Services
服務
服務
Services
首頁 > 服務
Swift 建庫服務

一、服務內容


我公司提供的Swift建庫服務是基于Swift公司提供的不同文庫構建試劑盒,對DNA樣本進行文庫構建,建成適用于illumina測序平臺的DNA測序文庫。

 

二、建庫分類及特點


1、Accel-NGS 1S DNA 建庫

利用Swift創新技術設計的適用于Illumina? 平臺的單鏈 DNA文庫構建試劑盒,也適用于雙鏈DNA和質量較差的DNA樣品(缺刻﹑損傷或含有小片段)。接頭連接效率高、較低的樣品輸入量,起始量低至10pg,生成的文庫序列質量高﹑覆蓋度均勻??捎糜诤昊蚪M學研究、病毒基因組學研究、較難提取的微生物研究和熱變性致病菌研究。

1588225297784035.png


2、Accel-NGS 2S DNA 建庫

Accel-NGS 2S DNA文庫試劑盒操作簡便,包含了建庫必需的全部試劑,可兼容包括微生物、FFPE以及cfDNA樣品等多種樣品類型。應用范圍廣,既適用于PCR-free全基因組測序及ChlP-Seq,也可結合雜交捕獲用于靶向重測序。Accel-NGS 2S試劑盒提供優化的標簽序列,既有樣品標簽(sample indices)用于多樣品文庫混合測序,還有分子標簽(molecular identifiers, MIDs)用于數據分析時過濾重復序列。


1588225336239292.png


3、Swift Amplicon 16S+ITS 建庫

—種基于單管反應微生物高通量綜合分析方法。解析復雜的宏基因組樣品可以覆蓋16S rRNA的所有可變區和真菌的ITS1、ITS2基因區域。解決了測序復雜度問題獨特的擴增子化學試劑產出多樣性的簇,不需要PhiX或者定相引物,有效reads數量至少增加了 20%。節約成本適應多種Illumina園測序機型和測序讀長,增大了選擇的靈活性,可訂購384種index試劑盒pooling更多樣品。Swift Amplicon 16S + ITS PanelB基于16S rRNA可變區(V1-V9)和ITS基因設計的單管多重引物體系,有利于對復雜的微生物群落(例如細菌,古菌,真菌)的NGS分析。


1588225385547805.png

1588225404918859.png


4、Accel-NGS 甲基化DNA建庫

Accel-NGS-Methyl-Seq DNA文庫試劑盒最大限度地提高了亞硫酸氫鈉轉化樣品的DNA回收率,并構建了準確表示樣品組成的文庫。 Accel-NGS-Methyl-Seq工作流程通過利用與單鏈亞硫酸氫鈉轉化DNA兼容的高效 adapter連接,制備亞硫酸氫鈉處理后的文庫,最大限度地恢復DNA。這個方法的文庫產量比庫構建后再亞硫酸氫鈉轉化的方法高出100倍。此外,Accel-NGS-Methyl-Seq試劑盒的 adapter連接與模板無關,提供了一個更完整、更底偏好的文庫,這是從全基因組甲基化測序(WGBS)對甲基組的全面覆蓋中觀察到的。 已在gDNA、cfDNA、FFPE和古DNA樣本中得到過驗證,使用同樣的樣品起始量,需要擴增循環數更低 。建庫起始量的要求低至100pg,Swift先對DNA進行重亞硫酸鹽處理再建庫,對比其它先建庫再重亞硫酸鹽處理的方法,可保持原始DNA分子的多樣性和降低DNA的投入量??蓮V泛應用于 全基因組甲基化測序(WGBS)、簡化甲基化測序(RRBS)、雜交捕獲的靶向測序、通過ChIP或其它方法富集得到的重亞硫酸鹽轉化的DNA。

卓越的文庫復雜度和覆蓋度:為了證明Accel-NGS-Methyl-Seq試劑盒的有效性和無偏性,我們使用100ng、10ng或1ng擬南芥基因組DNA進行了滴定實驗,并與使用相同樣本量的兩種替代方法(隨機引物和傳統方法)進行了比較。


1588233022877957.jpg


三、樣品要求


1、Accel-NGS 1S DNA 建庫

DNA 濃度大于0.5ng/ul。

DNA 樣品體積大于10ul。

DNA 總量大于10ng。

DNA 的吸光度260/280比值在1.7-2.1之間。


2、Accel-NGS 2S DNA 建庫

DNA 濃度大于5ng/ul。

DNA 樣品體積大于10ul。

DNA 總量大于50ng。

DNA 的吸光度260/280比值在1.7-2.1之間。


3、Swift Amplicon 16S+ITS 建庫

DNA 濃度大于1ng/ul。

DNA 樣品體積大于10ul。

DNA 總量大于20ng。

DNA 的吸光度260/280比值在1.7-2.1之間。


4、Accel-NGS 甲基化DNA建庫

DNA 濃度大于5ng/ul。

DNA 樣品體積大于10ul。

DNA 總量大于50ng。

DNA 的吸光度260/280比值在1.7-2.1之間。


注意:請附送一管DNA樣品的溶解介質。

請務必保證樣品運送過程中溫度保持在4度以下,夏季以干冰運送為好。 


新诛仙手游能赚钱吗 广西快乐十分快三 江苏十一选五码走势图 中央五为啥不播NBA 津乐天津麻将手机版下载 pk10一分赛车技巧图片 江苏11选5中奖表 手机兼职赚钱app 大盘行情 湖北快三技巧公式 7k7k小游戏麻将